No início de abril de 2020, o plano de contingência concentrou os trabalhos no Centro de Saúde da Madalena devido à pandemia de COVID-19. Embora estejam já em curso algumas medidas de flexibilização no Pico, a presidente do conselho de administração da Unidade de Saúde da Ilha do Pico diz ainda não haver condições para retomar a normalidade nas unidades de São Roque e das Lajes.
Cláudia Cabrita, em declarações À RTP/Açores afirmou que a manutenção desta reorganização assenta não só numa questão de segurança e proteção, mas também na falta de recursos humanos.

A centralização de serviços de atendimento permanente deverá manter-se na Madalena até ao final de Maio.